Δύο παραμένουν τα «αγκάθια» για την ανάπτυξη της κρουαζιέρας: Από τη μία, η έλλειψη συντονισμού που παρατηρείται σε πολλά λιμάνια, όσον αφορά στον προγραμματισμό των αφίξεων των πλοίων και από την άλλη, η απουσία σχεδιασμού για την ανάπτυξη υποδομών κρουαζιέρας.
Χαρακτηριστικό παράδειγμα της δεύτερης περίπτωσης είναι η Λήμνος, όπου τα κρουαζιερόπλοια το καλοκαίρι δε μπορούν να δέσουν, με αποτέλεσμα οι τουρίστες να επιβιβάζονται σε βάρκες.
Αναγκαία κρίνεται, τέλος, η υιοθέτηση ταχύτερων διαδικασιών από τα τελωνεία, αλλά και τις αστυνομικές αρχές για την έγκριση των προϋποθέσεων επιβίβασης και αποβίβασης επιβατών από χώρες εκτός Ε.Ε.